A perda de diversidade em regiões tropicais tem sido pauta em diversas discussões governamentais e não governamentais, com foco principalmente na fragmentação e destruição de ecossistemas naturais. No entanto, tomadas de decisões sobre a conservação de recursos genéticos precisam ser pautadas em parâmetros genéticos populacionais, especialmente para as espécies com interesse econômico que são alvo de maior interferência humana. Este trabalho teve como objetivo definir e avaliar parâmetros genéticos para a conservação de populações de jatobá (Hymenaea courbaril) na região sul-ocidental da Amazônia brasileira. A espécie é uma das que possuem madeira mais valiosa e é uma das mais intensamente exploradas na Amazônia brasileira. O estudo foi realizado em três áreas de florestas preparadas para a exploração madeireira, segundo plano de manejo sustentável. Calculou-se, com uso de oito locos de marcadores microssatélites, a diversidade genética, os estimadores para a conservação da espécie e a divergência entre as populações. As populações com menor densidade populacional (< 0,08 ind.ha-1) apresentaram maior diversidade genética e índice de fixação elevado. A população com maior densidade populacional (0,25 ind.ha-1) foi a que apresentou menor diversidade genética e ausência de endogamia. A Área Mínima Viável para conservação da espécie foi compatível com a realidade do local de estudo, com uma ressalva de uma das populações onde há necessidade de uma área muito maior em relação às demais. A divergência genética foi elevada (G’ST = 0,344) e as populações foram classificadas como Unidades Independentes para o Manejo.
The loss of diversity in tropical regions has been focus on several governmental and non-governmental discussions, focusing mainly on the fragmentation and destruction of natural ecosystems. However, decisions about the conservation of genetic resources must be guided by population genetic parameters, especially for species with economic interests that are subject to greater human interference. This study aimed to define and evaluate genetic parameters for the conservation of populations of Hymenaea courbaril in southwestern Amazon. This species is one of the most valuable and intensively exploited wood species in the Brazilian Amazon. We studied three forest areas prepared for logging in the background of sustainable management. It was calculated with eight microsatellite loci, genetic diversity, intra-population conservation estimators and genetic divergence among populations. Genetic diversity and fixation index were higher in the low density populations (< 0.08 ind.ha-1). The most density population (0.25 ind.ha-1) showed the lowest genetic diversity and no inbreeding. The Minimum Viable Area for species conservation was consistent with the reality of the studied areas, with a proviso for one of the populations where there is a need for a much larger area than the other to conserve populations. The genetic divergence was high (G’ST = 0.344) and the populations were considered Independent Management Units.