Prospecção de genes tecido específico e metabólitos em Elaeis spp.

Abstract

Objetivou-se neste trabalho realizar a prospecção e validação de genes que possuam expressão em tecido específico (folha) presentes no genoma da espécie Elaeis oleífera (Kunth) Cortés (caiaué). Também, a elaboração de um protocolo eficiente que possibilite a identificação de metabólitos secundários presentes em folhas da espécie Elaeis guineensis Jacq (palma de óleo) com o uso da espectrometria de massas acoplada à cromatografia líquida de Ultra Alta Eficiência (UHPLC-MS). Para a etapa de prospecção, foram realizadas buscas em bancos de dados genômicos por genes que indicavam expressão específica em folha. Após serem realizadas as etapas de alinhamento das sequências dos genes candidatos com o draft do genoma do caiaué, os resultados foram validados com o uso da técnica de reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR). Foram testados dois tecidos (folha e raiz) para comparação da diferença de expressão. Como resultado, obteve-se indicação de maior expressão relativa do gene MyBHV5 no tecido folha quando comparado ao tecido raiz e confirmação da presença deste gene no genoma do caiaué. Enquanto com o uso da técnica de UHPLC-MS foi possível elaborar um protocolo de extração de metabólitos secundários, presentes em folhas de palma de óleo, o qual se mostrou eficiente, simples e com boa reprodutibilidade. Foi possível a identificação de possíveis compostos os quais deverão ter sua elucidação estrutural realizada em estudos futuros.

The aim of this study was the exploration and validation of genes that have expression in specific tissue (leaf) present in the species Elaeis oleifera (Kunth) Cortés (caiaué) genome. Also, the development of an efficient protocol that enables the identification of secondary metabolites in leaves of the species Elaeis guineensis (oil palm) with the use of mass spectrometry coupled to liquid chromatography ultra high efficiency (UHPLC-MS). To step prospecting searches in genomic databases for genes that showed specific expression in leaf data were performed. After aligning the sequences of the candidate genes in the genome caiaué be performed, the results were validated using the technique of polymerase chain reaction in real time (qPCR). Two tissues (root and leaf) to compare differences in expression were tested. As a result was obtained indicating highest relative MyBHV5 gene expression in leaf tissue compared to root tissue and confirmation of the presence of this gene in the genome caiaué. While using the UHPLC-MS technique was possible to develop a protocol for extraction of secondary metabolites in leaves of palm oil which is efficient, simple and with good repeatability. It was possible to identify secondary metabolites which must be performed structural elucidation in future studies.