Phylogenetic relationships among genera Eucalyptus and Corymbia species based on rnDNA internal transcribed spacers sequences

Abstract

Relações filogenéticas entre espécies introduzidas no Brasil, pertencentes ao gênero Eucalyptus, subgênero Symphyomyrtus (secções Adnataria, Exsertaria, Maidenaria e Transversaria) e espécies do gênero Corymbia (secções Politaria e Ocharia) foram inferidas por meio da análise das seqüências do gene 5.8S do DNA ribossômico nuclear e das regiões ITS1 e ITS2 que o flanqueiam. As seqüências das espécies E. globulus ssp. globulus e A. bakeri (gênero Angophora) foram extraídas do banco de dados “Genbank” e incluídas na análise. A espécie Psidium guajava foi utilizada como “outgroup”. O programa computacional Clustal X foi utilizado para o alinhamento das seqüências e a árvore filogenética foi obtida a partir do Método de Agrupamento do vizinho mais próximo (Saitou and Nei, 1987). A seqüência região 5.8S mostrou ser bastante conservada em todas as espécies investigadas, embora algumas variações tenham sido detectadas nas seqüências desse gene, principalmente quando foram comparadas às seqüências das espécies dos gêneros Angophora, Corymbia e Eucalyptus. As regiões ITS1 e ITS2 apresentaram variações em suas seqüências, para todas as espécies investigadas. A análise da árvore filogenética permitiu constatar nítida separação entre os gêneros Corymbia e Eucalyptus. A espécie A. bakeri, agrupou-se com as espécies do gênero Corymbia. Dentro do gênero Symphyomyrtus, gênero Eucalyptus, as espécies da secção Maidenaria formaram um agrupamento que incluiu a espécie E. globulus ssp globulus, cuja seqüência foi extraída do banco de dados e incluída na análise. As espécies das secções Adnataria, Exsertaria e Transversaria não formaram grupos distintos, característicos de cada secção. As divergências observadas entre os dados morfológicos (classificação de Pryor and Johnson, 1971) e os moleculares obtidos no presente estudo são, provavelmente, devido aos sucessivos cruzamentos interespecíficos e às possíveis introgressões que ocorreram no material em estudo.

Phylogenetic relationships between Eucalyptus species, subgenus Symphyomyrtus (sections Adnataria, Exsertaria, Maidenaria, and Transversaria), and Corymbia species (sections Politaria and Ocharia) were established based on the sequence of internal transcribed rDNA spacers (ITS1 and ITS2). The species analyzed were obtained from a collection kept in Brazil. Fragments obtained using primers ITS1 and ITS2 were sequenced and part of the sequence of ITS1 and ITS2 and the complete sequence of 5.8S rDNA were used in the analysis. ITSs and 5.8S rDNA sequences from E. globulus ssp. globulus and A. bakeri (Genus Angophora) were downloaded from the Genbank database and included in the analysis. Psidium guajava was the selected outgroup used. The sequence alignment and a Neighbor-joining tree were obtained using Clustal X. Few variations were detected in the 5.8S rDNA sequences obtained, occurring mainly between Eucalyptus and Corymbia, thus defining these genera. Variations in ITS sequences occurred in all investigated species. Phylogenetic analysis showed a clear separation between the genera Corymbia and Eucalyptus. A. bakeri was more closely related to species belonging to genus Corymbia. Regarding the subgenus Symphyomyrtus (Genus Eucalyptus), only species from section Maidenaria grouped together according to their common section. This could have been caused by the removal of natural reproductive barriers when these species were introduced in Brazil, with a consequent increase in the rate of interspecific crossings and introgression events.