Planejar a conservação na Amazônia é um grande desafio. A heterogeneidade de hábitats é grande mesmo em escalas pequenas. Para planejar a conservação, é necessário entender como a variação nas comunidades biológicas está relacionada com a variação ambiental e geográfica. Neste estudo, usando pteridófitas (samambaias e plantas afins) com modelo, foram investigadas as diferenças na composição da comunidade entre as parcelas em relação à algumas características ambientais locais e à distância entre as parcelas. Foram amostradas 38 parcelas de 0,0625 ha distribuídas em 150 km2 de floresta nativa da Amazônia Central. Os resultados mostram que o teor de argila é o principal fator que determina substituição gradual de espécies ao nesta escala e que a abertura do dossel influencia a composição de maneira sutil. A abertura do dossel está negativamente relacionada à riqueza, provavelmente porque muitas espécies de pteridófitas são susceptíveis a pequenas variações na entrada de luz no subosque. A distância florística entre as parcelas não esteve relacionada à distância geográfica entre elas, sugerindo que samambaias não são limitadas pela dispersão nessa escala. A heterogeneidade da comunidade de pteridófitas pode estar sendo mal representada em reservas pequenas, pois a Amazônia é um complexo mosaico de hábitats e organismos.
Conservation planning in Amazon is a big challenge. The heterogeneity of habitats is high even in small scales. The understanding of the relationships of biological communities and environmental and geographic variation is needed for conservation planning. The differences of the composition of pteridophytes (ferns and fern allies) between plots due to some local environmental characteristics and geographic distance between plots were evaluated. Thirty eight plots of 0,0625 ha in 150 km2of undisturbed forest in Central Amazon were sampled. The results show that clay content is the main gradient determining species turnover. Canopy openness is negatively related with richness, probably because many species of pteridophytes are susceptible to small increases of light penetration in the understory. The floristic distance between plots was not related to geographical distance, suggesting that ferns are not dispersal limited at this scale. The heterogeneity of pteridophyte communities maybe misrepresented in small reserves because the Amazon is a complex mosaic of habitats and organisms.